К сожалению стандартный сервер скачанный с minecraft.net и установленный по многочисленным инструкциям так запустить и не смог. Однако! почитав еще чуть составил таки рабочий вариант. Предлагаю следующую инструкцию.

1) Открываем доступ на Raspberry по ssh
sudo raspi-config
Интерфейсы -> SSH
2) Установить java
sudo apt-get install default-jdk
3) Устанавливаем git
sudo apt-get install git
4) Ставим пакет Java BuildTools для Minecraft
sudo wget https://hub.spigotmc.org/jenkins/job/BuildTools/lastSuccessfulBuild/artifact/target/BuildTools.jar
sudo java -jar BuildTools.jar
На этом этапе запасаемся терпением минут 40.. После того как закончится работа скрипта, выполняем пробный запуск сервера:
sudo java -Xms512M -Xmx1008M -jar /home/minecraft/spigotlatestbuild.jar nogui
Сервер откажется запускаться пока вы не откроете файл eula.txt и не проставите true
5) Отредактируем настройки
sudo mcedit/home/minecraft/server.properties
view-distance=04
max-player=5
6) Добавим в автозапуск
sudo mcedit /etc/rc.local
sudo java -Xms512M -Xmx1008M -jar /home/minecraft/spigotlatestbuild.jar nogui &&